型號: AZ00008
儲運條件
-20℃
產(chǎn)品組成
產(chǎn)品簡介
基于重組原理的無縫克隆技術(shù),作為新一代的克隆方法,不依賴繁瑣的酶切、連接步驟,也不需要末端補平等操作,依據(jù)DNA 片段與線性化載體末端的15~25 nt 同源序列的重組,可將插入片段克隆至任意線性載體的任意位點,載體自連背景低,是一種簡單、快速的DNA 定向克隆技術(shù)。
Fast One Step Cloning Kit 無縫克隆試劑盒,一次反應(yīng)可完成單至多個DNA 片段的重組,快僅需5 分鐘即可完成單片段重組,且陽性率高于95%。Kit 中添加的輔助因子,有效提高克隆陽性率;經(jīng)優(yōu)化的反應(yīng)體系,能夠一定程度上耐受未純化PCR 產(chǎn)物中含有的雜質(zhì)。升版的無縫克隆試劑盒具有更高的陽性率、更好的兼容性。
實驗步驟
1. 實驗流程概要
2. 線性化克隆載體制備
選擇合適的克隆位點,對載體進行線性化,載體的線性化可以通過酶切或反向PCR 擴增完成。
① 酶切制備
一些限制性內(nèi)切酶不能有效地消化超螺旋DNA,因此可能會留下不同數(shù)量的未切割載體DNA,降低陽性率。推薦使用LightNingTM 快速內(nèi)切酶進行酶切(單酶切或者雙酶切),使載體線性化wanquan,以降低轉(zhuǎn)化背景(未切割的載體轉(zhuǎn)化獲得的假陽性克隆)。
注1:經(jīng)酶切進行線性化的載體無需去磷酸化,推薦使用雙酶切。
注2:酶切完成后,建議將內(nèi)切酶失活或?qū)δ康漠a(chǎn)物純化后用于重組反應(yīng)。
② 反向PCR 擴增制備
為減少擴增突變的引入,推薦使用高保真PCR Mix 進行擴增。推薦使用預(yù)線性化質(zhì)粒作為模板,以減少環(huán)狀質(zhì)粒模板殘留對克隆陽性率的影響。
注1:PCR 產(chǎn)物無非特異性條帶時, 推薦使用Template Eliminator( 貨號:EG21203)消化質(zhì)粒模板即可用于重組反應(yīng);反之建議將PCR 產(chǎn)物純化后使用。
注2:多片段克隆時,建議將PCR 產(chǎn)物純化后使用。
3. 插入片段PCR 引物設(shè)計
PCR 引物的5' 端必須包含與其相鄰片段(插入片段或載體)末端同源的15~25 nt(推薦18 nt)序列。假如載體為粘性末端,且3' 端突出,則引物設(shè)計必須包含突出部分;若5' 端突出,則引物設(shè)計可以包含突出部分,也可以不包含。
插入片段正向擴增引物:
5'—上游載體末端同源序列+ 酶切位點(可選)+ 基因特異性正向擴增序列— 3'
插入片段反向擴增引物:
3'—基因特異性反向擴增序列+ 酶切位點(可選)+ 下游載體末端同源序列—5'
注1:盡量選擇無重復(fù)序列且 GC 含量均勻的區(qū)域進行克隆,當(dāng)載體克隆位點上下游25 nt 區(qū)域內(nèi) GC 含量為40%~60% 時,重組效率高;
注2:本試劑盒所提供的pUC 19 載體(Ampr)連接端序列如下:
4. 插入片段的PCR 擴增
推薦使用高保真PCR Mix 進行擴增,以減少擴增突變的引入。建議使用純化后的PCR 產(chǎn)物進行無縫克隆反應(yīng),若PCR 產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳鑒定為特異性擴增產(chǎn)物,可直接使用,但加樣體積不應(yīng)超過總反應(yīng)體積的20%。
5. 重組反應(yīng)
① 于冰水浴中配置以下反應(yīng)體系:
a. 適載體用量(ng) = 0.02 × 載體堿基對數(shù),即0.03 pmol。
b. 插入單片段,適片段用量(ng)= 0.04 × 片段堿基對數(shù);插入多片段,每片段適用量(ng)= 0.02 × 片段堿基對數(shù)。
注1:若插入單片段的長度大于載體,則應(yīng)互換載體與插入片段用量;
注2:若插入片段的長度小于200 bp,則插入片段應(yīng)使用5 倍載體用量;
注3:若按上述公式計算得到的用量超過低/ 高值,則建議直接按低/ 高用量使用;
注4:載體片段過長、插入片段過長或片段數(shù)過多,克隆陽性率均會降低。
重組反應(yīng)體系配制完成后,用移液槍輕輕吸打混勻各組分,避免產(chǎn)生氣泡,切勿渦旋。
② 將反應(yīng)體系置于50℃,反應(yīng)5~60 min。
注1:推薦使用 PCR 儀等溫控比較jingzhun的儀器進行反應(yīng),反應(yīng)時間不足或太長克隆效率均會降低;
注2:插入1~2 個片段時,推薦反應(yīng)時間為5~15 min;插入3~5 個片段時,推薦反應(yīng)時間為15~30 min;
注3:當(dāng)載體骨架在10 kb 以上或插入片段在4 kb 以上時,建議延長反應(yīng)時間到30~60 min;
注4:50℃反應(yīng)完成后,建議進行瞬時離心,將反應(yīng)液收集至管底。
③ 將反應(yīng)液離心管置于冰上冷卻,之后進行轉(zhuǎn)化或者儲存于 -20℃。
注 1: -20℃儲存的重組產(chǎn)物,建議在 1 周內(nèi)使用。
6. 重組產(chǎn)物轉(zhuǎn)化
取5~10 μl 反應(yīng)液,加入到100 μl 感受態(tài)細胞中,緩慢吸打混勻,冰上放置30 min。42℃ 熱激45~60 sec,冰浴5 min。加500 μl SOC或 LB 培養(yǎng)基,37℃ 振蕩培養(yǎng)40~60 min(200 rpm)。將菌液均勻涂布在含有對應(yīng)抗生素的平板上,倒置于37℃ 過夜培養(yǎng)。
注1:不同感受態(tài)細胞后的克隆陽性率會有所差別,推薦使用轉(zhuǎn)化效率 > 108 CFU/μg的感受態(tài)細胞;
注2:菌落數(shù)取決于PCR 產(chǎn)物與線性化載體的數(shù)量和純度;
注3:陽性對照平板通常生長大量白色單菌落,陰性對照平板只生長很少的菌落。
7. 陽性克隆檢測
挑取單菌落至10 μl ddH2O 中混勻,95℃裂解10 min 后,取1 μl裂解液作為模板,進行菌落PCR 鑒定,或?qū)尉浣臃N至抗性培養(yǎng)基中培養(yǎng)過夜后,提取質(zhì)粒進行酶切鑒定。
陽性對照的陽性克隆檢測,菌落PCR 引物使用通用引物M13F 與M13R,酶切鑒定用HindIII 與EcoRI。
注1:菌落PCR 時建議至少使用一條通用引物,避免假陽性結(jié)果;
注2:必要時可進一步對陽性結(jié)果進行測序鑒定。
注3:M13F:TGTAAAACGACGGCCAGT
M13R:CAGGAAACAGCTATGAC
原創(chuàng)作者:上海創(chuàng)凌生物科技有限公司
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