自噬是一個吞噬自身細胞質(zhì)蛋白或細胞器并使其包被進入囊泡,并與溶酶體融合形成自噬溶酶體,降解其所包裹的內(nèi)容物的過程,藉此實現(xiàn)細胞本身的代謝需要和某些細胞器的更新。
標記及追蹤LC3以及自噬流的變化。其中GFP是酸敏感型GFP蛋白,而mRFP是穩(wěn)定的熒光表達基團,不受外界影響。由于自噬小體進入第二階段后,與溶酶體進行融合,形成自噬溶酶體。自噬溶酶體由于溶酶體內(nèi)部的酸性環(huán)境,可以導致PH下降,GFP淬滅,因此,GFP的減弱可指示自噬溶酶體形成的順利程度,GFP越少,則從自噬小體到自噬溶酶體階段流通得越順暢。反之,自噬小體和溶酶體融合被抑制,自噬溶酶體進程受阻。mRFP是一直穩(wěn)定表達的,因而可以通過GFP與mRFP的亮點比例來評價自噬流進程。
實驗方法
Step1:細胞培養(yǎng)
Step2:轉(zhuǎn)染或藥物處理
Step3:細胞收集
Step4:添加LC3-GFP-RPF病毒感染
Step5:熒光檢測
結(jié)果展示
自噬流
自噬誘導劑
a)Bredeldin A / Thapsigargin / Tunicamycin :模擬內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激
b)Carbamazepine/ L-690,330/ Lithium Chloride(氯化鋰):IMPase 抑制劑(即Inositol monophosphatase,肌醇單磷酸酶)
c)Earle's平衡鹽溶液:制造饑餓
d)N-Acetyl-D-sphingosine(C2-ceramide):Class I PI3K Pathway抑制劑
e)Rapamycin:mTOR抑制劑
f)Xestospongin B/C:IP3R阻滯劑
自噬抑制劑
a)3-Methyladenine(3-MA):(Class III PI3K) hVps34 抑制劑
b)Bafilomycin A1:質(zhì)子泵抑制劑
c)Hydroxychloroquine(羥氯喹)
自噬的評估通常采用多個自噬階段的標志物,因為自噬小體數(shù)量的增加可能是自噬上調(diào)也可能是自噬階段降解被抑制所致,所以設(shè)置合適的對照很有必要。
1. 透射電鏡
2. WB檢測標志物LC3/Atg8和p62/SQSTM1
3. WB檢測Lamps、Atg5、Atg14和Beclin-1
4. 組織蛋白酶Cathepsin活力檢測
5. IF檢測自噬流auhagicflux返回搜狐,查看更多